客戶采用鏈霉親和素磁珠捕獲DNA探索DNA主動去甲基化新途徑——論文通訊
武漢大學和北京大學國家重點實驗室采用鏈霉親和素磁珠捕獲DNA探索DNA主動去甲基化新途徑。
摘要:可以通過十一個11易位(TET)雙加氧酶介導的5mC氧化為5-羥甲基胞嘧啶(5hmC),5-甲?;奏ぃ?fC)和5-羧基胞嘧啶(5caC)來實現(xiàn)5-甲基胞嘧啶(5mC)的主動去甲基化由胸腺嘧啶DNA糖基化酶(TDG)啟動的堿基切除修復(fù)(BER)。 TDG-BER途徑可能導致DNA鏈斷裂的產(chǎn)生,從而可能損害基因組完整性。另外,TET產(chǎn)生的5caC的直接脫羧具有很高的吸引力,因為這種機制允許5mC轉(zhuǎn)化為胞嘧啶而不會形成DNA鏈斷裂。然而,人類細胞中5caC中C–C鍵的裂解仍是一個懸而未決的問題。我們使用攜帶5caC的發(fā)夾DNA底物在細胞提取物和活細胞中檢查了該反應(yīng)。與全細胞蛋白質(zhì)提取物一起溫育或轉(zhuǎn)染到人類細胞中后,我們使用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS / MS)分析在單核苷酸和寡脫氧核苷酸水平上通過直接脫羧或BER監(jiān)測了5caC向胞嘧啶的轉(zhuǎn)化。我們的結(jié)果清楚地表明,人類細胞中5caC可以直接轉(zhuǎn)化為胞嘧啶,為支持DNA主動去甲基化的新途徑提供了證據(jù)。
https://www.chinesechemsoc.org/doi/full/10.31635/ccschem.020.202000286
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