磁珠法VS硅膠柱法，未來核酸提取方法誰主沉浮？
15年前中國大部分的 實驗室都還在使用酚氯仿抽提核酸，用戶以為核酸純化試劑盒都是來自國外的進口產品。
15年過去了，現在的分子生物學實驗室酚氯仿抽提基本消失，Trizol試劑是碩果僅存，尚有普遍使用的酚氯仿核酸提取方法。還有一種方法是煮沸法，其原理是先加熱變性蛋白，再離心去沉淀蛋白，最后取核酸上清。但是煮沸法本質上并未進行核酸純化，只是把蛋白變性沉淀下來而已，因此它的缺陷也顯而易見：核酸片段短，抑制物含量高，應用范圍僅局限在PCR檢測中--以擴增檢測幾百bp的目的片段為主，如果你想P一個5kb的基因，煮沸法提取的核酸幾乎不可行，因為大部分核酸都已經降解成1-2kb以下的小片段了, 適合擴增的長片段模板含量太低。
目前主流的核酸純化方法只剩磁珠法和硅膠柱法了。那么應該選擇磁珠法還是硅膠柱法呢？硅膠柱技術的廠家說磁珠法得率低，純度差，效果不好；磁珠法廠家說硅膠柱法即將被淘汰，童靴們都糊涂了，到底咋回事？
其實磁珠法和硅膠柱法原本是一家。Marko在1982年發(fā)表的文獻：A procedure for the large-scale isolation of highly purified plasmid DNA using alkaline extraction and binding to glass powder. Anal. Biochem.121, 382-387，里面詳細描述了如何用玻璃粉吸附DNA，并進行純化的過程。
玻璃的主要成分就是二氧化硅，磁珠只不過是在四氧化三鐵的微球表面涂上一層二氧化硅（玻璃介質）而已。具體原理是什么呢？說實話小編也不是很清楚，據說核酸溶液是一種膠體溶液，外層有水化層和電荷層，水化層或是電荷層被奪走后就變得粘稠了--大家可以想象一下酚氯仿抽提后的水相，加醇了以后，界面出現了粘稠的核酸，可用玻璃棒粘走核酸--大概就是核酸的水化層被剝離后變得粘稠了，從而黏附到玻璃介質上了，看來玻璃（SiO2)確實是黏附核酸的好東東。
極小的玻璃球就是玻璃粉或者是磁硅珠。一切似乎都很完美，可問題是，如果核酸太多了一點，就會把玻璃球黏在一起，緊密黏在一起的小團不僅黏住了殘留的蛋白，還滯留了鹽分，怎么解決？
把玻璃棒拉細，超級細，直到變態(tài)細，就做成了玻璃纖維。把玻璃纖維疊個N層，當然還是疏松的，卻不會像玻璃珠那樣堆積在一起。于是蛋白不容易黏上，鹽分也容易清洗掉了----這個就是做在純化柱中的硅膠膜。
這么說，硅膠柱法應該是玻璃粉法的升級版了？實測確實如此，硅膠柱法純化核酸的純度，回收效率都優(yōu)于玻璃粉法。
隨著分子生物學的不斷發(fā)展，要求全自動提取基因提上日程，大批量處理樣本的醫(yī)療機構用戶（那可是有錢人哦）對自動化的要求日益迫切。硅膠柱法需要高速離心機（大于10000g以上），其在自動化操作上異常困難，加載有硅膠柱的自動化核酸純化儀器非常復雜，比如QIAGEN的QIAcube全自動核酸純化儀 ，就整合了離心機、加熱震蕩器、移液體系和自動抓取器，雖然完整地延續(xù)了硅膠柱法的高純度和高回收率的優(yōu)勢，但儀器價格昂貴，應用受到限制。
于是磁珠法應運而生，在磁珠表面包上一層二氧化硅，替代傳統的玻璃粉法，就可以實現磁場分離替代離心分離的作用，很容易實現儀器上的操作自動化，但是磁珠法仍然存在玻璃粉法的缺陷，提取的核酸純度低、鹽分殘留高。
因此，硅膠柱法不會消失--特別是科研用戶，并不需要大批量的樣本進行核酸純化，更關注的是核酸的回收效率、純度，這些卻是磁珠法的硬傷。磁珠法更適合于低濃度核酸的提取，為了提高核酸提取的純度，對磁珠表面改造也是重要的發(fā)展方向。
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