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用于組氨酸標(biāo)簽蛋白純化的Ni親和磁珠

2018-1-27 19:34:46點(diǎn)擊:


1.       組氨酸標(biāo)簽蛋白

蛋白質(zhì)表面的一些氨基酸,如組氨酸、色氨酸、半胱氨酸等能與多種金屬離子(Ca2+、Mg2+、Ni2+、Co2+等)發(fā)生特殊的相互作用,這些作用包括配位結(jié)合、靜電吸附、共價(jià)鍵結(jié)合,其中以配位結(jié)合為主,而且這其中又以His-Tag標(biāo)簽成為蛋白純化的首選標(biāo)簽:

a)         N末端的His-Tag與細(xì)菌的轉(zhuǎn)錄翻譯機(jī)制兼容,有利于蛋白表達(dá);

b)        采用固定化金屬離子親和層析純化His-tag融合蛋白操作簡(jiǎn)便;

c)         His-Tag對(duì)目的蛋白本身特性幾乎沒(méi)有影響,而不像GST標(biāo)簽?zāi)菢尤菀仔纬啥唧w,從而影響蛋白特性;

d)        His-Tag非常小,不會(huì)改變目的蛋白自身的可溶性,相反一些大的標(biāo)簽如MBP,可大大提高融合蛋白的可溶性,盡管目的蛋白本身是不可溶或者折疊不正確;

e)         His-Tag非常小,在融合蛋白結(jié)晶后對(duì)蛋白結(jié)構(gòu)沒(méi)有影響;

f)         N末端的His-Tag可通過(guò)蛋白內(nèi)切酶去除;

g)        His-Tag既可用于活性蛋白表達(dá)的純化標(biāo)簽,也可用于包涵體表達(dá)的純化標(biāo)簽。

在重組蛋白末端融合多個(gè)組氨酸成串的肽段(如圖1-1),憑借其與二價(jià)金屬離子的螯合作用(如圖1-2),從而利用親和作用純化蛋白。標(biāo)簽長(zhǎng)度及暴露程度常影響標(biāo)簽與金屬離子的相互作用,常用的His標(biāo)簽是6個(gè)重復(fù)的組氨酸,但在實(shí)際操作過(guò)程中,根據(jù)實(shí)際情況可控制組氨酸數(shù)目從4-10個(gè)不等。較短的標(biāo)簽與金屬離子的結(jié)合更弱,較長(zhǎng)的標(biāo)簽與金屬離子的結(jié)合更強(qiáng);而金屬離子只能和蛋白表面的 His 結(jié)合,所以 His 標(biāo)簽暴露程度越高,結(jié)合能力越強(qiáng)。金屬螯合親合層析(Immobilized metal ion affinity chromatography,IMAC,如圖1-3),為His-Tag純化標(biāo)簽的重組蛋白質(zhì)的分離純化提供了一個(gè)有力的工具。


1-1. His-Tag綠色熒光蛋白


1-2. His-TagNi2+的螯合作用



1-3. 金屬螯合親合層析柱

His-Tag標(biāo)簽也存在一些缺點(diǎn),主要有:

a)       His-Tag有可能被降解脫落;

b)      在金屬離子存在下可能形成二聚體或四聚體;

c)       在其它蛋白含相鄰組氨酸殘基的情況下,洗脫時(shí)可能會(huì)帶入雜蛋白。

 

1.       His-Tag蛋白磁分離純化流程

傳統(tǒng)的His-Tag蛋白多利用金屬螯合親合層析柱進(jìn)行層析分離。磁性納米粒子作為一種新型的介質(zhì),利用其在磁場(chǎng)下可快速分離的特點(diǎn),通過(guò)在磁珠表面螯合Ni2+離子,進(jìn)而將其用于His-Tag蛋白的純化,具有速度快、容易放大、可自動(dòng)化操作等諸多優(yōu)點(diǎn)。His-Tag蛋白通過(guò)磁性介質(zhì)進(jìn)行分離純化的一般流程是裂解、吸附、洗滌、洗脫四個(gè)步驟,如圖1-4所示,在流程中經(jīng)常在洗脫步驟之前增加若干洗滌步驟以除去吸附較弱的非His-Tag蛋白,以期獲得純度更高的目標(biāo)蛋白。

pH是影響蛋白結(jié)合和洗脫的重要因素,一般來(lái)說(shuō),結(jié)合發(fā)生在中性偏堿的環(huán)境(6.5 - 8.0),洗脫多在偏酸性的環(huán)境(< 6.0)。His標(biāo)簽蛋白在中性或弱堿性pH值(pH7到8)環(huán)境下顯現(xiàn)出比在酸性條件下與金屬離子更強(qiáng)的結(jié)合能力。在磷酸緩沖液中His標(biāo)簽蛋白表現(xiàn)出比在Tris-HCl緩沖液中與金屬離子更強(qiáng)的結(jié)合能力。咪唑由于可以和His標(biāo)簽蛋白競(jìng)爭(zhēng)與金屬離子的結(jié)合,所以緩沖液中咪唑濃度的升高,會(huì)導(dǎo)致His標(biāo)簽蛋白與金屬離子結(jié)合能力的減弱。一些可以鰲合Ni離子的試劑如EDTA或檸檬酸等等蛋白與金屬離子的結(jié)合能力有較大影響,應(yīng)避免使用。蛋白分離過(guò)程主要涉及細(xì)胞裂解結(jié)合液、洗滌液和洗脫液。

a)       細(xì)胞裂解結(jié)合液Lysis buffer(Buffer pH,Salt concentration,Stabilizer)

pH:>pI還是<pI;

NaCl:100-300 mM;

Glycerol:5-15 %,…CPI, mild detergent, β-ME

b)      洗滌液Washing Buffer

Lysis buffer + imidazole (1-40 mM) varies from protein to protein

c)       洗脫液Elution Buffer

Lysis buffer + 100-300 mM imidazole


圖1-4. 磁性介質(zhì)分離純化His-Tag蛋白的一般流程

 

緩沖液配置基本原則:低咪唑上樣,高咪唑洗脫,或高pH上樣,低pH洗脫,如圖1-5。



a)       pH對(duì)組氨酸電離的影響

b)      咪唑與組氨酸的競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合

1-5. 組氨酸標(biāo)簽蛋白洗脫原理

 

固定化金屬親和磁珠(immobilized metal affinity magnetic bead, IMAMB)可以用于可溶性蛋白和包涵體蛋白的純化,兩種方法所需緩沖液不同,具體配置方法表1-1和表1-2。

表1-1. 可溶性組氨酸標(biāo)簽蛋白純化所需緩沖液及配方

名稱(chēng)

體積

配方

結(jié)合緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06 g Tris)
300 mM NaCl (17.53 g NaCl)
20 mM Imidazole (1.36 g imidazole)
使用HCl溶液調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

清洗緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06 g Tris)
300 mM NaCl (17.53 g NaCl)
20 mM Imidazole (1.36 g imidazole)
使用HCl溶液調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

洗脫緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06 g Tris)
300 mM NaCl (17.53 g NaCl)
300 mM Imidazole (20.4 g imidazole)
使用HCl溶液調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

 

表1-2. 包涵體組氨酸標(biāo)簽蛋白純化所需緩沖液及配方

名稱(chēng)

體積

配方

結(jié)合緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06g Tris)
300 mM NaCl (17.53g NaCl)
8 M Urea (480.50 g Urea)
使用HCl調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

清洗緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06g Tris)
300 mM NaCl (17.53g NaCl)
8 M Urea (480.50 g Urea)
使用HCl溶液調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

洗脫緩沖液

1L

50 mM Tris (6.06g Tris)
300 mM NaCl (17.53g NaCl)
8 M Urea (480.50 g Urea)
300 mM Imidazole (20.4g imidazole)
使用HCl溶液調(diào)節(jié)pH8.0,
使用0.22或者0.45 μm濾膜過(guò)濾除菌。

 

上述緩沖液體系適用于多數(shù)組氨酸標(biāo)簽蛋白的純化,在結(jié)合緩沖液中添加一定濃度的咪唑可以降低非特異性結(jié)合,提高目的蛋白的純度。初次使用的客戶(hù),可以采用推薦的緩沖液,再根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行調(diào)整緩沖液配方及緩沖液中的咪唑濃度。

固定化金屬離子介質(zhì)是非常穩(wěn)定的,但在有螯合劑的情況下其金屬離子就會(huì)脫落,所以在純化His-Tag融合蛋白時(shí),通常螯合劑EDTA和EGTA必須從溶液中去除。Audur Magnusdottir等人認(rèn)為,在E. coli的裂解液普遍存在一些非特異的弱螯合劑,如在三羧酸循環(huán)中產(chǎn)生了二羧酸類(lèi)物質(zhì);E. coli在面臨某些壓力情況下,會(huì)產(chǎn)生高特異性的金屬螯合劑——Metallophores,這是由于這些螯合劑的存在導(dǎo)致His-Tag融合蛋白純化的純度和產(chǎn)量大大降低。這些螯合劑一般存在于細(xì)菌的細(xì)胞周質(zhì)中,可通過(guò)一個(gè)簡(jiǎn)單的步驟除去這些螯合劑,使得His-TagTM蛋白的純度和產(chǎn)量得到提高。固定化金屬離子介質(zhì)通常需要考慮在表1-3所列試劑中的穩(wěn)定性。

表1-3. 固定化金屬離子介質(zhì)穩(wěn)定性考察因素

Reagents

Stability

Reductants

還原劑

5 mM DTE

0.5-1mM DTT

20 mM β-mercaptoethanol

5 mM TCEP

10 mM reduced glutathione

Denaturants

變性劑

8 M urea

6 M Gua-HCl

Detergent

表面活性劑

2% Triton? X-100 (nonionic)

2% Tween? 20 (nonionic)

2% NP-40 (nonionic)

2% cholate (anionic)

1% CHAPS (zwitterionic)

Other additives

其它添加劑

500 mM imidazole

20% ethanol

50% glycerol

100 mM Na2SO4

1.5 M NaCl

1 mM EDTA

60 mM citrate

Buffer

緩沖液

50 mM sodium phosphate, pH 7.4

100 mM Tris-HCl, pH 7.4

100 mM Tris-acetate, pH 7.4

100 mM HEPES, pH 7.4

100 mM MOPS, pH 7.4

100 mM sodium acetate, pH 4

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