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一、概述
氨基活化瓊脂糖磁珠(Magarose-NH2)是一種6%交聯(lián)的磁性瓊脂糖微球,磁珠在長間隔臂的末端含有反應(yīng)性伯胺,含有羧基(-COOH)的分子共價偶聯(lián),用于親和純化。凝膠對于固定肽而言是理想的,用于抗體或其他結(jié)合配偶體的親和純化。
盡管其他胺反應(yīng)性方法可將分子固定化在氨基活化瓊脂糖磁珠上,但碳二亞胺(EDC)在交聯(lián)劑中是獨特的,使得能夠通過-COOH偶聯(lián)。在近中性至酸性pH緩沖液中,EDC能有效地與羧酸鹽反應(yīng)形成中間體酯,其與親核試劑如氨基活化瓊脂糖磁珠上的伯胺反應(yīng)。在大多數(shù)親和純化方法中,分子和瓊脂糖凝膠載體之間產(chǎn)生的酰胺鍵是穩(wěn)定的,并且可防滲漏。
氨基活化瓊脂糖磁珠也適用于通過5'-磷酸基團固定寡核苷酸。在咪唑存在下,EDC以與羧酸鹽大致相同的方式有效地與磷酸基團反應(yīng)。
二、產(chǎn)品特性
產(chǎn)品名稱
Magarose-NH2
貨號
PMAG018,PMAG019
磁珠濃度
25% (v/v) in 0.02% sodium azide
配基密度
~ 60 μmol NH2/ ml磁珠
介質(zhì)
6%交聯(lián)磁性瓊脂糖
粒徑
20-45μm
配體結(jié)合
>20 mg IgG/ml磁珠
保存
常溫運輸,2~8℃保存一年
注:磁珠蛋白結(jié)合量與目標蛋白特性相關(guān),此處僅作參考值。
三、使用方法
1. 重要產(chǎn)品信息
? 使用EDC時,氨基磁珠將與C-末端、天冬氨酸或谷氨酸殘基的側(cè)鏈-COOH相偶聯(lián)。因為肽還含有伯胺(N-末端和賴氨酸殘基的側(cè)鏈),使用EDC的偶聯(lián)將導(dǎo)致肽的聚合以及它們固定到凝膠支持物上。通常這種聚合對隨后的親和純化方法無害。
? 連接水不溶性肽或其他分子時,請使用與水混溶的溶劑,如乙醇、甲醇、DMSO或DMF。首先將肽溶解在水混溶性溶劑中,然后將該溶液加入偶聯(lián)緩沖液中。偶聯(lián)反應(yīng)中高達50%的有機溶劑濃度是相容的,除非已知肽在該濃度下變性。
? 傳統(tǒng)上,MES緩沖液用于EDC反應(yīng),因為它不含有競爭性的胺或磷酸鹽,并且有效地保持了最佳的偶聯(lián)酸條件。然而,如果需要,可以替換其他緩沖液,并且偶聯(lián)將有效地進行至pH 7.2。盡管磷酸鹽緩沖液可以與EDC反應(yīng),但降低偶聯(lián)效率。乙酸鹽、Tris和甘氨酸緩沖液與EDC或O-?;愲逯虚g體反應(yīng),不是合適的偶聯(lián)緩沖液。另外,避免使用含有硫醇的緩沖液,這些硫醇不可逆地結(jié)合EDC并使之失活。碘化物、氯化物和溴化物等鹵化物對pH值為5和7之間的EDC幾乎沒有影響。
? EDC / Magarose-NH2方法也可用于通過5'-磷酸基團固定寡核苷酸。
2. 使用EDC和Magarose-NH2的肽固定化方法
注意:此方法使用2mL 磁珠Magarose-NH2(8mL漿液)偶聯(lián)1-10mg肽。對于其他體積、肽量請相應(yīng)調(diào)整程序。
A. 所需材料
· 偶聯(lián)緩沖液:0.1M MES緩沖液[2-(N-嗎啉代)乙磺酸],0.9%NaCl,pH4.7
? 洗滌液:1M NaCl
? EDC [1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亞胺HCl]
B. 試劑制備
將1-10mg肽溶解在2mL偶聯(lián)緩沖液中。為了估計肽偶聯(lián)后的偶聯(lián)效率,測量該樣品在280nm處的吸光度。(該方法假設(shè)肽在280nm處吸收,可以使用檢測肽的存在的其他波長與單獨的偶聯(lián)緩沖液)。
C. 磁珠準備
小心地將8mL 磁珠移入玻璃瓶,磁分離,移除上清液。加入10ml偶聯(lián)緩沖液平衡磁珠。磁分離,去除上清,磁珠備用。
D. 肽偶聯(lián)
1) 在打開前將EDC樣品瓶平衡至室溫,以避免水分凝結(jié)到樣品瓶中。
2) 將2mL制備的肽樣品加入磁珠中,輕輕顛倒混合樣品/磁珠漿液數(shù)分鐘。
3) 將0.5mL偶聯(lián)緩沖液加入60mg EDC中。
注意:EDC對水分敏感,當溶解在水性緩沖液中時會迅速水解。為獲得最佳效果,請將干粉試劑密封在-20°C的干燥劑中密封在其原始樣品瓶中。在使用前立即快速溶解所需量的試劑,并丟棄任何未使用的溶液。
4) 在EDC溶解后,立即將0.5mLEDC溶液加入步驟2的樣品/磁珠漿液中。在室溫下輕輕混合反應(yīng)漿3小時。
5) 磁分離,移除上清液。加入2mL洗滌液,磁分離,收集上清液。將兩部分上清液混合,用于測定偶聯(lián)效率。
注意:收集的樣品(~4mL)含有未結(jié)合的肽。為了測量偶聯(lián)效率,比較該溶液與起始肽樣品的吸光度,考慮2倍稀釋效應(yīng)。
6) 向磁珠中加入2mL洗滌液,洗滌三次。
7) 磁分離后的磁珠,用磷酸鹽緩沖鹽水(PBS)或含有0.05%疊氮化鈉的其它合適緩沖液平衡,4℃下保存。
3. 通過5'-磷酸基團固定核酸或寡核苷酸的方法
注意:每1μg待偶聯(lián)的寡核苷酸使用1μL凝膠(4μL混合漿液)。
? 0.1M咪唑,pH6
? 超純DNase和/或RNase水
B. 核酸或寡核苷酸偶聯(lián)
1) 混合Magarose-NH2漿液,以獲得均勻的磁珠懸浮液。使用移液槍將適量的磁珠轉(zhuǎn)移到微量離心管中。
2) 磁分離并棄去上清液。
3) 用2個磁珠沉降體積的超純水清洗磁珠3-5次,磁分離并每次除去上清液。
4) 對于每微升使用的磁珠,在1μL的0.1M咪唑(pH6)中溶解至多10μg的DNA或RNA。
5) 將核酸溶液加入凝膠中并充分混合。
6) 稱取1mg 的EDC并溶解在67μL的0.1M咪唑中(pH6)。
7) 對于每微升磁珠,加入2μL的EDC溶液。
8) 在室溫下?lián)u動或混合反應(yīng)3小時。
9) 磁分離并除去含有未結(jié)合核酸的上清液。
10) 用2個磁珠體積的水或適當?shù)南礈煲海ɡ鏣ris-EDTA)洗滌磁珠3-5次,離心并每次棄去上清液。
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