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【產(chǎn)品介紹】
PuriMag NGSbead基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理 ,配合精心優(yōu)化過的緩沖體系,用于二代測序文庫構建過程中的DNA片段分選 、純化。 本產(chǎn)品可適用于各品牌DNA 、RNA建庫試劑盒,和目前廣泛使用的AMPure XP Beads使用方式相同,片段回收效率和文庫大小分布 均與 AMPure XP Beads高度吻合。
【保存方法及注意事項】
l 常溫運輸。 2-8℃保存 ,效期 一年 。避免冷凍避免冷凍 !
l 磁珠使用前 須在室溫平衡至少30min。
l 80%乙醇需現(xiàn)用現(xiàn)配,否則將影響回收效率。
l 進行長度分選時,初始樣品體積需≥100μL,不足時請用超純水補齊。樣品體積太小,將導致移液誤差增大,進而影響分選的準確性 。
l 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。
【文庫大小分選參考條件】
用PuriMag NGSbead構建DNA文庫。經(jīng)過1×PuriMag NGSbead純化后,再按表1的條件進行分選,得到不同大小的文庫,用Agilent 2100 Bioanalyzer進行分析。
表1. 磁珠文庫分選推薦比例
插入片段平均長度(bp)
250
250-350
350-450
450-550
550-650
650-750
第一輪體積比
0.80×
0.70×
0.60×
0.55×
0.50×
0.45×
第二輪體積比
0.20×
0.15×
注意:1.8x bead:所有片段純化;1.0x bead :Primers + small amplicons去除;0.65x – 0.25x bead片段分選。
【試劑盒組成】
組分
100次
保存
PuriMag NGSbead
5 ml
2-8℃
Wash buffer
80%乙醇(用戶自備)
常溫
Elution buffer
圖2. 磁珠法雙輪分選流程圖
【操作步驟】
1. 準備工作
將磁珠由冰箱中取出,室溫平衡至少30 min。配制80%乙醇。
2. 雙輪分選
1)請渦旋振蕩或充分顛倒磁珠以保證混勻 。
2)根據(jù)要求,參考表1向DNA溶液中加入第一輪分選磁珠,渦旋混勻或移液器吹打10次混勻。
3)室溫孵育5min。
4)將離心管短暫離心并置于磁力架中 ,待溶液澄清后(約 5min),小心轉移上清到干凈的離心管中 。
注意:轉移上清時,請勿吸取磁珠即使微量殘留都將影響后續(xù)文庫質量。
5)參考表1向上清中加入第二輪分選磁珠 。
6)渦旋混勻或移液器吹打10次混勻,室溫靜置 5min。
7)將離心管置于磁力架中,待溶液澄清后(約 5min),小心移除上清 。
8)保持EP管始終處于磁力架中,加入 200μl新鮮配制的 80%乙醇漂洗磁珠,室溫孵育30 s,小心移除上清 。
9)重復步驟 8。
10) 保持離心管始終處于磁力架中,開蓋干燥磁珠至剛出現(xiàn)龜裂(約 5min)。
注意 :切記磁珠不要干燥時間太久,磁珠干燥過度將影響純化效果。
11 ) 將離心管從磁力架中取出,加入適量ddH2O(≥20 μL),渦旋振蕩或使用移液器輕吹打充分混勻 。
12 ) 保持EP管始終處于磁力架中,小心吸取上清至干凈EP管中,即完成分選。
客戶文章:
1. Li X, Chen L, Liu T, et al. Integrated analysis of ATAC-seq and transcriptomic reveals the ScDof3-ScproC molecular module regulating the cold acclimation capacity of potato[J]. Plant Physiology and Biochemistry, 2024, 210: 108576.
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