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【產(chǎn)品介紹】
本試劑盒是用來從葉子、種子等植物組織和植物培養(yǎng)細(xì)胞等植物樣品中快速提取和純化植物基因組DNA。本試劑盒是利用磁硅珠能吸附破碎溶液中的基因組DNA 的原理來回收DNA。無需借助苯酚等有害的試劑來進(jìn)行除蛋白操作,就能簡(jiǎn)便地抽提出基因組DNA?;厥盏?span>DNA 可以直接用于下游進(jìn)行酶切、PCR、二代測(cè)序和基因芯片等分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)。本試劑盒除可與核酸自動(dòng)抽提裝置組合使用外,還可與磁分離架一起使用,作為進(jìn)行固液手動(dòng)分離的試劑盒。
【特點(diǎn)】
l 高效率:可以從葉子、種子等組織和培養(yǎng)細(xì)胞等植物樣品中抽提出高純度的基因組DNA。
l 簡(jiǎn)便/短時(shí)間:利用磁硅珠對(duì)基因組DNA 的吸附性,能簡(jiǎn)便地在短時(shí)間內(nèi)抽提出基因組DNA。
l 可進(jìn)行高純度的DNA 抽提: 本試劑盒抽提的基因組DNA,幾乎不含RNA 和蛋白質(zhì)等雜質(zhì),可直接用于PCR 等的酶反應(yīng)。
【保存方法及注意事項(xiàng)】
1) 裂解液低溫儲(chǔ)存可能會(huì)出現(xiàn)白色絮狀漂浮物,在使用前65℃預(yù)熱至白色絮狀物完全溶解,不影響使用效果。
2)磁珠使用前要充分混勻。
3)如果下游實(shí)驗(yàn)對(duì)RNA污染比較敏感,可在裂解時(shí)加入1ul 的RNaseA (10mg/ml)。
4)如果是干材料,適當(dāng)延長(zhǎng)裂解時(shí)間,種子用粉碎機(jī)打成粉末狀使用,樣品為種子時(shí),裂解時(shí)間為30min。
5)如果同等取樣量下欲得到更多DNA可增加洗脫次數(shù)(洗脫次數(shù)最好不要超過3次),也可適當(dāng)延長(zhǎng)裂解時(shí)間。
【試劑盒組成】
組分
100次
保存
Lysis Buffer
50 ml
常溫
PuriMag bead
2 ml
2-8℃
Wash buffer
75%乙醇(用戶自備)
Elution buffer
5 ml
RNase A
2 ml(選配試劑)
異丙醇
用戶自備
DNA濃度及純度檢測(cè) :(1)得到的基因組DNA片段大小與樣品保存時(shí)間、操作過程中剪切力等因素有關(guān),所得DNA片段可用瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)濃度和純度。 (2)DNA應(yīng)在OD260處有顯著吸收峰,OD260=1相當(dāng)于大約50ng/ul雙鏈DNA,40ng/ul單鏈DNA。OD260/OD280比值應(yīng)為1.7~1.9,如果洗脫時(shí)使用去離子水,比值會(huì)偏低,因?yàn)?span>pH和離子會(huì)影響吸光度,并不表示純度低。
【操作步驟】
取材量參考下面表格:
材料
取樣量
新鮮植物葉片
50~200 mg
干葉片
10~30 mg
大豆種子
5~30 mg
小麥種子
玉米種子
以從50 mg~200 mg植物葉片中提取基因組DNA為例:
1)取新鮮植物組織或粉狀干燥組織50mg~200mg,用液氮在研缽中研磨充分,加入1ml的Lysis Buffer(65℃預(yù)熱)研磨均勻,然后轉(zhuǎn)移到1.5ml的EP管,混合均勻。
2)將EP管置于恒溫水箱中65℃溫浴30~60min,期間不時(shí)搖動(dòng),溫浴結(jié)束后,12000rpm離心10min。
3)取200ul上清液于新的1.5ml的EP管中,加入20ul 的RNA酶混勻,5min后加入20ul的 PuriMag bead、200ul異丙醇,顛倒混勻靜置5min后,將EP管置于磁力架上磁分離,吸棄上清液。
4)移去磁力架,加入800ul的Wash Buffer,振蕩混勻靜置5min后,將EP管置于磁力架上磁分離,吸棄上清液。若有團(tuán)狀或絲狀物可增加振蕩時(shí)間及力度。重復(fù)該步驟一次。
5)移去磁力架,加入100ul的Elution Buffer,移液槍緩慢吹打混勻1~2min,將離心管在磁力架上靜置0.5min,小心吸走上清液放入新離心管即為提取的DNA,存放于2-8℃,長(zhǎng)期存放需置于-20℃。(洗脫液在65-70 ℃中預(yù)熱后洗脫效果更好,減小洗脫體積或多次洗脫可增大DNA濃度。)
【常見問題即處理建議】
常見問題
可能的原因
建議
得率
樣品沒有研磨充分
盡量將樣品研磨充分
樣品裂解完后,沒有離心直接進(jìn)行下一步操作
如樣品裂解后,一定要離心后,再進(jìn)行下一步操作。
樣品用量過大
嚴(yán)格按說明書程序進(jìn)行
程序設(shè)置不準(zhǔn)確
條帶彌散
研磨時(shí)間太長(zhǎng)
迅速研磨防止DNA降解
環(huán)境溫度太高
可將研缽置于-20℃預(yù)冷20min后再進(jìn)行研磨,如所提材料基因組極易降解,用液氮研磨
樣品不新鮮或樣品反復(fù)凍融多次
盡量用新鮮樣品試驗(yàn)
裂解時(shí)間太長(zhǎng)
裂解時(shí)間不超過60min
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