DNA提取經(jīng)典方法之——植物組織DNA提取
一、材料
水稻幼苗或其它禾本科植物,幼嫩葉子。
二、設(shè)備
移液器,冷凍高速離心機(jī),臺(tái)式高速離心機(jī),水浴鍋,陶瓷研缽,50ml離心管(有蓋)及5ml和1.5ml離心管,彎成鉤狀的小玻棒。
三、試劑
1、提取緩沖液Ⅰ:100mmol/L Tris?Cl,pH8.0,20mmol/L EDTA,500mmol/L NaCl,1.5% SDS。
2、提取緩沖液Ⅱ:18.6g葡萄糖,6.9g二乙基二硫代碳酸鈉,6.0gPVP,240μl巰基乙醇,加水至300ml。
3、80:4:16/氯仿:戊醇:乙醇
4、RnaseA母液
5、其它試劑:液氮、異丙醇、TE緩沖液,無水乙醇、70%乙醇、3mol/L NaAc。
四、操作步驟
(一)水稻幼苗或其它禾木科植物DNA提取
1.在50ml離心管中加入20ml提取緩沖液Ⅰ,60℃水浴預(yù)熱。
2.水稻幼苗或葉子5-10g,剪碎,在研缽中加液氮磨成粉狀后立即倒入預(yù)熱的離心管中,劇烈搖動(dòng)混勻,60℃水浴保溫30-60分鐘(時(shí)間長,DNA產(chǎn)量高),不時(shí)搖動(dòng)。
3.加入20ml氯仿/戊醇/乙醇溶液,顛倒混勻(需帶手套,防止損傷皮膚),室溫下靜置5-10分鐘,使水相和有機(jī)相分層(必要時(shí)可重新混勻)。
4.室溫下5000rpm離心5分鐘。
5.仔細(xì)移取上清液至另一50ml離心管,加入1倍體積異丙醇,混勻,室溫下放置片刻即出現(xiàn)絮狀DNA沉淀。
6.在1.5ml eppendorf中加入1ml TE。用鉤狀玻璃棒撈出DNA絮團(tuán),在干凈吸水紙上吸干,轉(zhuǎn)入含TE的離心管中,DNA很快溶解于TE。
7.如DNA不形成絮狀沉淀,則可用5000rpm離心5分鐘,再將沉淀移入TE管中。這樣收集的沉淀,往往難溶解于TE,可在60℃水浴放置15分鐘以上,以幫助溶解。
8.將DNA溶液3000rpm離心5分鐘,上清液倒入干凈的5ml離心管。
9.加入5μl RNaseA(10μg/μl),37℃ 10分鐘,除去RNA(RNA對(duì)DNA的操作、分析一般無影響,可省略該步驟)。
10.加入1/10體積的3mol/L NaAc及2×體積的冰乙醇,混勻,-20℃放置20分鐘左右,DNA形成絮狀沉淀。
11.用玻棒撈出DNA沉淀,70%乙醇漂洗,再在干凈吸水紙上吸干。
12.將DNA重溶解于1ml TE,-20貯存。
13.取2μl DNA樣品在0.7% Agarose膠上電泳,檢測DNA的分子大小。同時(shí)取15μl稀釋20倍,測定OD260/OD280,檢測DNA含量及質(zhì)量。
[注意] 5g樣品可保證獲得500μg DNA,足供RFLP、PCR等分析之用。
(二).從李(蘋果)葉子提取DNA
1.取3-5克嫩葉,液氮磨成粉狀。
2.加入提取緩沖液Ⅱ10ml,再研磨至溶漿狀。10000rpm,10min。
3.去上清液,沉淀加提取液Ⅰ20ml,混勻。65℃,30-60min,常搖動(dòng)。
4.同本節(jié)(一)中步驟3-13操作。
(三).Purimag磁珠用于提取DNA
使用Purimag的核酸提取磁珠,可以高效提取植物組織DNA。通常在經(jīng)典方法沉淀DNA步驟之前加入磁珠,即可讓DNA吸附在PuriMag磁珠表面,洗脫后即可得到高純度的DNA。
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